多肽是用來模擬蛋白的，為了模仿蛋白的表現(xiàn)，我們需要合成與蛋白有相似的結構和電荷的多肽 。當一條肽段從一個蛋白中“切出”之后，兩端的電荷數(shù)將與基因體蛋白有差異。我們需要改變合成策略來使他們一致。

總體而言：

如果是出自蛋白C端的序列，通過乙酰化將N端屏蔽；

如果是出自蛋白N端的序列，通過酰胺化將C端屏蔽；

如果是出自蛋白中間部分，用乙酰化和酰胺化將兩端都屏蔽