江蘇吉泰肽業(yè)科技有限公司
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在多肽固相合成中,氨基酸缺失是最常見最嚴(yán)重的問題之一。缺失肽與目標(biāo)多肽的不同在于少了一個或幾個氨基酸,一般情況下,這些缺失肽的極性與目標(biāo)多肽的極性是非常接近的,從而增加了純化的難度。
上圖展示了使用SPPS合成的>40mer的多肽,即使經(jīng)過細(xì)致的二維HPLC純化后,把絕大多數(shù)的雜質(zhì)給分走了,但仍然有缺失肽未能完全分開。這說明了缺失肽嚴(yán)重的影響固相多肽的合成純度。下面給大家介紹缺失肽的成因以及如何避免其形成。
1.氨基酸偶連不完全
在固相合成中,氨基酸偶連不完全是缺失肽形成的重要原因之一。在氨基酸偶連后,進(jìn)行封端能夠避免極性相近的缺失肽的形成。一般情況下,封端肽要比缺失肽更容易分離與辨認(rèn)。
避免缺失肽形成的策略:每步偶連氨基酸后進(jìn)行封端處理或者至少在難偶連的氨基酸后進(jìn)行封端。
2.Fmoc保護(hù)基脫除不完全
脫除Fmoc保護(hù)基不完全導(dǎo)致的氨基酸缺失:
對Fmoc難脫除的反應(yīng)進(jìn)行監(jiān)控:
避免缺失肽形成的策略:辨明難脫除的Fmoc保護(hù)基位點(diǎn)并優(yōu)化其脫保護(hù)條件。
3.二酮哌嗪的形成
二酮哌嗪的形成導(dǎo)致雙氨基酸的缺失:
避免缺失肽形成的策略:
(1)避免容易形成二酮哌嗪的N端的序列;
(2)當(dāng)N端容易發(fā)生環(huán)化形成二酮哌嗪時(shí),避免使用強(qiáng)酸或強(qiáng)堿等;
(3)使用大位阻的樹脂。
4.未對反應(yīng)不完全的樹脂進(jìn)行封端
未對樹脂上未反應(yīng)的反應(yīng)位點(diǎn)進(jìn)行封端會導(dǎo)致C端缺失肽的形成。
避免缺失肽形成的策略:確保樹脂完全反應(yīng)。
5.原料含有雜質(zhì)
比如說,在自己準(zhǔn)備的二肽原料中含有雜質(zhì),這樣也會導(dǎo)致缺失肽的產(chǎn)生:
避免缺失肽形成的策略:嚴(yán)格控制用于固相合成的原料純度。
6.反應(yīng)體系中出現(xiàn)醛或酮
Kent發(fā)現(xiàn)含有醛基的樹脂會引起缺失肽的產(chǎn)生。醛基或酮羰基會通過如下圖反應(yīng)的機(jī)理來使N端無法正常偶連,從而產(chǎn)生缺失肽。
除了樹脂上的醛或酮羰基以外,溶劑或原料中的醛或酮也會對裸露的N端進(jìn)行暫時(shí)性的封端,從而導(dǎo)致缺失肽的產(chǎn)生。
避免缺失肽形成的策略:確保用于固相合成的樹脂、溶劑、試劑和反應(yīng)物中沒有醛或酮類雜質(zhì)。
總結(jié):
1.產(chǎn)生缺失肽的原因有很多;
2.在固相合成中,抑制缺失肽的形成是非常重要的,這樣能降低分離純化的難度;
3.避免缺失肽產(chǎn)生的策略有很多,具體采取何種策略必須根據(jù)實(shí)際情況而定;
4.必須嚴(yán)格控制固相合成中的原料純度、反應(yīng)條件等因素,這樣才能減少缺失肽的產(chǎn)生。